Medizinische Fakultät:
Core Unit Bioinformatics - CUBiMed.RUB
Schwerpunkt Bioinformatik der Proteomik

Wir suchen zum 15.08.2026 befristet in Vollzeit (39,83 Std./Woche = 100 %) einen

**Wissenschaftlichen Mitarbeiterin (m/w/d) mit dem Schwerpunkt bioinformatische und statistische Modellierung und Vorhersage von Proteomics-Daten**

Die Core Unit Bioinformatics - CUBiMed.RUB an der Medizinischen Fakultät bietet ein breites Spektrum an Bioinformatik-Ressourcen für Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler aus den Lebenswissenschaften. Als Core Unit bieten wir Beratung und Analysen, Schulungen und Tutorien, Software und Zugang zu leistungsstarker Hardware. Der Schwerpunkt liegt z. B. auf Proteomik und klinischen Forschungsdaten. Neben dem Anbieten bestehender Infrastruktur sollen auch Auswertemethoden weiterentwickelt und neue Services/Software Libraries angeboten werden.

Der Forschungsbereich ist an der Core Unit Bioinformatik „CUBiMed.RUB“ an der Medizinischen Fakultät beteiligt. CUBiMed.RUB bietet ein breites Spektrum an Bioinformatik-Ressourcen für Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler in den Lebenswissenschaften (Analysen, Schulungen und Tutorien, Software und Zugang zu leistungsstarker Hardware).

Umfang:

Vollzeit

Dauer:

befristet, 31.12.2027

Beginn:

zum 15.08.2026

Bewerben bis:

15.06.2026

Ihre Aufgaben:

Im Rahmen der ausgeschriebenen Stelle soll die einzustellende Person verschiedene Services und Trainings im Bereich Bioinformatik der Proteomik anbieten:

Tools: PIA (Protein Inference Algorithms): Toolbox für die Protein-Inferenz bei massenspektrometrie-basierten Proteomik-Daten; CalibraCurve: Tool für die Kalibrierung von targeted Proteomik-Messungen; Workflows: Bereitstellung von out-of-the-box Workflows (auch für unerfahrene Nutzer) für verschiedene Analysen im Bereich der Bioinformatik der Proteomik
Datenbanken: MaCPepDB: Datenbank aller tryptischen Peptide aus UniProt
Beratungsservices: Bioinformatik- und Statistik-Beratung und Analyseservice: Beratungen und Durchführen von Analysen im Bereich Bioinformatik der Proteomik; Statistik-Beratung und Analyseservice:
Beratungen und Durchführen von Analysen bzgl. der statistischen Auswertung von Proteomik- und dazugehörigen klinischen Daten
Weiterentwicklung vorhandener Services oder Neuentwicklung von Services / Software Libraries
de.NBI Cloud Service: Bereitstellung von Workflows zur Bioinformatik der Proteomik in der de.NBI-Cloud und Beratung zur Nutzung
Formulierung von Berichten und Mitarbeit an wissenschaftlichen Publikationen
Nach ausführlicher Einarbeitung, selbstständiges Einarbeiten in weitere Themen in der Proteomik-basierten Bioinformatik wie weitere/neuere Peptid-Suchmaschinen/Quantifizierungs-Methoden
Promotion

Ihr Profil:

Erfahrung in der Analyse empirischer Forschungs- und klinischer Daten, vorzugsweise im Umfeld lebenswissenschaftlicher oder medizinischer Forschung
Sehr gute Kenntnisse in statistischer Datenanalyse sowie sehr gute Programmierkenntnisse in R
Gute Kenntnisse in Machine Learning
Kenntnisse in Stan, Mplus
Kenntnisse über „Deconvolution Problems“ und „Parsimonious Modelling“
Sicherer Umgang mit LaTeX zur Erstellung wissenschaftlicher Dokumentationen
Erfahrung im Umgang mit omics-, multi-omics- oder anderen datenintensiven Forschungsdaten
Fähigkeit zur eigenständigen Konzeption, Umsetzung und Dokumentation komplexer Analyse- und Infrastrukturprozesse
Erfahrung in universitären Forschungsprojekten
interdisziplinären Arbeitsumgebungen inkl. intensiver Kommunikation mit klinischen Kooperationspartnern
Erfahrung im Unternehmenskontext
Grundkenntnisse in C/C++ oder SAS
Hochschulabschluss mit einer Gesamtnote von mindestens 1,7
Sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Wir bieten:

Anspruchsvolle und abwechslungsreiche Aufgaben mit hoher Eigenverantwortung

Weitergehende Informationen:

Die Beschäftigung erfolgt im Angestelltenverhältnis und richtet sich nach dem Tarifvertrag der Länder (TV-L).
Die Eingruppierung erfolgt bei Erfüllung der persönlichen und tariflichen Voraussetzungen in Entgeltgruppe E13 TV-L.

Der Dienstort ist die Ruhr-Universität Bochum.

Es wird mit einer qualifizierten Bewerbung gerechnet.

Die RUB versteht sich als Universität mit internationaler Ausstrahlung. Campussprachen sind Deutsch und Englisch. Kompetenzen in mindestens einer der beiden Sprachen und die Bereitschaft, sich die andere anzueignen, werden vorausgesetzt. Die RUB stellt entsprechende kostenfreie Angebote für Mitarbeitende zur Verfügung.

Der Personalrat hat das Recht, an allen Auswahlgesprächen teilzunehmen. Auf Wunsch einer bewerbenden Person (m/w/d) sichert er seine Teilnahme am gesamten Verfahren zu. Bitte wenden Sie sich an [email protected].

Die Ruhr-Universität Bochum (RUB) ist eine der führenden Forschungsuniversitäten in Deutschland. Als reformorientierte Campusuniversität vereint sie in einzigartiger Weise die gesamte Spannbreite der großen Wissenschaftsbereiche an einem Ort. Das dynamische Miteinander von Fächern und Fächerkulturen bietet den Forschenden wie den Studierenden gleichermaßen besondere Chancen zur interdisziplinären Zusammenarbeit.

Die RUB steht für Diversität und Chancengleichheit. Daher fördern wir die Zusammenarbeit heterogener Teams und den beruflichen Weg von Menschen, die in den jeweiligen Arbeitsbereichen unterrepräsentiert sind. Die RUB wünscht ausdrücklich die Bewerbung von Frauen. In Bereichen, in denen sie unterrepräsentiert sind, werden sie bei gleicher Qualifikation bevorzugt berücksichtigt. Bewerbungen von Menschen mit Behinderung sind uns ebenfalls sehr willkommen.

Ansprechpersonen für weitere Informationen:

Prof. Dr. Martin Eisenacher Tel.: +49 234 32 18104

Fahrtkosten, Übernachtungskosten und Verdienstausfall bzw. sonstige Bewerbungskosten für Vorstellungsgespräche können leider nicht erstattet werden.

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung unter Angabe der ANR 5774 bis zum 15.06.2026 über unser Online-Bewerbungsportal

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