Die Fakultät VI Medizin und Gesundheitswissenschaften umfasst die Bereiche Humanmedizin, Medizinische Physik und Akustik, Neurowissenschaften, Psychologie sowie die Versorgungsforschung. Zusammen mit den vier regionalen Krankenhäusern bildet die Fakultät VI die Universitätsmedizin Oldenburg. Weiterhin besteht eine enge Zusammenarbeit mit der Universitätsmedizin der Universität Groningen.
Der Sonderforschungsbereich (SFB) 1330 Hörakustik ist ein Verbundprojekt der Spitzenforschung, das durch die Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) gefördert wird. Beteiligt sind die Carl von Ossietzky Universität Oldenburg sowie weitere Partner.