In der Abteilung Pädiatrie werden jährlich etwa 3.500 Kinder stationär, 2.500 in der Tagesklinik und 10.000 in der Notfallambulanz gesehen sowie 3.000 im MVZ und in den Spezialambulanzen. Schwerpunkte der Abteilung liegen in den Bereichen Infektiologie, Gastroenterologie, Diabetologie/Endokrinologie, Pneumologie/Allergologie und Dermatologie.
Die Abteilung Neuropädiatrie betreut jährlich ca. 1.000 Kinder und Jugendliche voll- und teilstationär sowie weitere 1.000 Patient*innen in der Anfallsambulanz nach §116b. Medizinische Schwerpunkte der Neuropädiatrie sind u. a. Epilepsien (Epilepsiezentrum Hamburg), Tuberöse Sklerose (TSC-Zentrum Hamburg), Schlafstörungen, Kopfschmerzen und Entwicklungsstörungen.
Die Abteilungen für Pädiatrie und Neuropädiatrie werden derzeit jeweils von einem Chefarzt geleitet und bilden gemeinsam mit der Abteilung Neonatologie/Intensivmedizin das pädiatrische Zentrum. Die Abteilungen für Pädiatrie und Neuropädiatrie arbeiten eng verzahnt und stellen u.a. gemeinsam die Dienstbesetzungen sicher. Perspektivisch sollen beide Abteilungen durch einen Chefarzt / Chefärztin geleitet werden.