Am Universitären Herz- und Gefäßzentrum (UHZ) des Universitätsklinikums Hamburg-Eppendorf (UKE) denken wir klinische und translationale kardiovaskuläre Forschung direkt integriert in unsere tägliche Patientenversorgung. Unser Ökosystem verbindet umfassend phänotypisierte Kohortenstudien einschließlich Biobanking, strukturierte Nachuntersuchungen und moderne computergestützte Methoden.
Die Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) hat Dr. med. Shinwan Kany in das renommierte Emmy Noether-Programm aufgenommen. Das neu eingerichtete Forschungsprojekt befasst sich mit dem Thema „Risikostratifizierung für Vorhofflimmern und Herzschwäche bei Menschen mit seltenen Kardiomyopathie-Genvarianten mithilfe neuer Methoden“. Das Projekt zielt darauf ab, großskalige epidemiologische Daten, Cloud-Infrastrukturen und maschinelles Lernen miteinander zu verknüpfen, um prädiktive Modelle für Hochrisikopatienten zu entwickeln.
Ihre Aufgaben:
- Einrichtung und kontinuierliche Pflege des systematischen Zugriffs auf große genomische und phänotypische Datenbanken (insbesondere UK Biobank und All of Us).
- Verantwortung für das Datenmanagement sowie die Pipeline-Infrastruktur innerhalb dedizierter Cloud-Computing-Strukturen wie DNAnexus und der All of Us Cloud-Infrastruktur.
- Strukturierung und Harmonisierung der im klinischen Arbeitspaket (WP4) erhobenen Register- und Patientendaten, einschließlich der Unterstützung bei der Pflege der TRUST-Kohorte.
- Koordination des datenschutzkonformen Datenaustauschs sowie des Rechtemanagements zwischen den Postdoktorand:innen und Doktorand:innen des Teams sowie der TRUST-Gruppe.
- Konzeption und Implementierung automatisierter Pipelines zur Qualitätssicherung und KI-gestützten Anomalieerkennung in heterogenen klinischen Datensätzen.
- Etablierung einheitlicher Code-Standards und Versionskontrollverfahren zur Sicherstellung einer reproduzierbaren Datenverarbeitung im Gesamtprojekt.
Wir freuen uns auf Ihren Lebenslauf, ein Motivationsschreiben, in dem Sie Ihre Interessen im Projekt sowohl aus technischer (Infrastruktur, Cloud-Computing) als auch aus klinischer Perspektive darlegen, Referenzprojekten, die Ihre fachliche Kompetenz im Datenmanagement belegen, sowie einer Beschreibung Ihres eigenen Beitrags zu diesen Projekten, und den Kontaktdaten von vorzugsweise drei Forschern, die sich bereit erklärt haben, Referenzschreiben zu verfassen.
Die Stelle ist auf drei Jahre befristet zu besetzen. Eine Verlängerung wird angestrebt und ist im zweiten Abschnitt des Emmy Noether Projekts bereits eingeplant.
