Die Fakultät VI Medizin und Gesundheitswissenschaften umfasst die Bereiche Humanmedizin, Medizinische Physik und Akustik, Neurowissenschaften, Psychologie sowie die Versorgungsforschung. Zusammen mit den vier regionalen Krankenhäusern bildet die Fakultät VI die Universitätsmedizin Oldenburg. Weiterhin besteht eine enge Zusammenarbeit mit der Universitätsmedizin der Universität Groningen.
Die Universitätsklinik für Anästhesiologie, Intensivmedizin, Notfallmedizin und Schmerztherapie (AINS) sowie die interdisziplinäre Klinik für Palliativmedizin am Klinikum Oldenburg decken das gesamte Spektrum des Fachgebietes ab. Sie vertreten die jeweiligen Fachgebiete klinisch wie wissenschaftlich und sind für die Ausbildung der Studierenden an der Carl von Ossietzky Universität Oldenburg verantwortlich.